据新华社，厄尔尼诺现象导致巴拿马降雨减少，巴拿马运河3日起下调每日允许船舶通行数量。
据巴拿马运河管理局发布的公告，由于为运河供水的人工湖水位下降，9月3日起，运河每日可用通行名额总数从36个减少到34个，其中，新巴拿马型船闸为9个，巴拿马型船闸25个。9月15日起每日通行名额总数将进一步减少到32个。船舶吃水深度从15.24米降至14.63米。
这条水闸式运河采取阶梯通行方式。船只必须“乘电梯”通行，经过一级级船闸升降船体。运河水源主要依靠雨水补给，储存在多个人工湖中。如果没有足够的水，升降船只的船闸将无法正常运转。
运河管理局水资源经理埃里克.科尔多瓦说：“水是运营(运河)最重要的资源，但4月至8月的累计降雨量缺口比历史平均水平低35.8%……短期内看不到改善迹象。”
巴拿马运河管理局表示，虽然巴拿马已进入雨季，且运河方面也采取了相应节水措施，但运河流域内降雨量仍不及预期。
受厄尔尼诺现象影响，巴拿马政府8月25日宣布全国进入紧急状态，以应对干旱、洪水等灾害风险及其对巴拿马运河航运、农业和能源（850101）供应等方面造成的影响。
