在产前诊断环节,当超声发现胎儿异常时,背后隐藏着怎样的遗传学病因?不同部位的超声异常,CNV-seq检测的阳性率究竟有多大?
近日,由邬玲仟教授团队牵头,中南大学湘雅医院(884301)、中南大学生命科学学院医学遗传中心等多家单位联合开展的一项大规模临床研究给出了一份详实的“中国答卷”。该研究纳入了19,452例胎儿样本,采用低深度全基因组测序技术CNV-seq,系统揭示了12种胎儿超声异常与染色体异常之间的关联,相关成果已在国际权威学术期刊Prenatal Diagnosis发表,这是迄今为止国内最大规模的多中心CNV-seq产前诊断临床研究,为我国产前遗传咨询提供了极具价值的参考数据。贝瑞基因(000710)为该研究提供技术支持。
本研究纳入了2016年1月至2020年10月来自全国的19,452例样本,其中超声异常样本共13,312例,涉及心血管系统异常、中枢神经系统异常及骨骼异常等12类超声异常;无超声异常但孕妇高龄的样本共6,140例。
胎儿超声异常与染色体非整倍体检出率
在胎儿超声异常组中,非整倍体的检出率为6.20%(825/13,312)。
孤立性超声异常组中,非整倍体检出率最高的是胎儿水肿32.58%(86/264),其次是淋巴水囊瘤24.76%(103/416)、 腹壁缺损12.57%(22/175)。
非整倍体的检出率随着超声异常数量的增加而升高:当胎儿出现两种超声异常时,染色体非整倍体的综合检出率从4.66%(551/11,818)升至16.07%(196/1220)。
值得注意的是,当胎儿同时存在胎儿水肿和淋巴水囊瘤时,染色体非整倍体检出率高达61.04%(47/77)。
胎儿超声异常与pCNV检出率
超声异常胎儿中pCNV检出率为6.19%(824/13,312),是对照组(1.82%,112/6,140)的3.4倍,其中腹壁缺损、心血管系统异常、骨骼异常、中枢神经系统异常、胎儿生长受限、呼吸系统异常的检出率均大于6%。
值得关注的是,在腹壁缺损中,孤立性脐膨出的pCNV检出率达8.13%(13/160),而孤立性腹裂未检出pCNV(0/15)。这提示两者的遗传学病因可能存在本质差异。
胎儿超声异常与染色体异常相关性
如图所示,本研究共阐明了12种胎儿超声异常与染色体异常之间的关联。
本研究首次报道:13q33.3-q34缺失与呼吸系统缺陷显著相关,以及3q25.2-q29重复与腹壁缺损显著相关。
这项迄今国内最大规模的多中心CNV-seq产前诊断研究,拓展了pCNVs的产前表型谱,并系统阐明了12类超声异常与染色体异常的关联,为产前遗传咨询提供了宝贵的参考数据,也为后续科研和临床实践提供了新线索。随着临床数据的积累,CNV-seq将在产前诊断领域发挥越来越重要的作用,助力精准医学时代的胎儿遗传风险评估。
未来,贝瑞基因(000710)将持续致力于技术创新与临床转化,与临床专家携手,为优生优育事业贡献力量。
